Бактериологический метод исследования применяется для диагностики инфекционных заболеваний с хроническим (реже — острым) течением. Некоторые случаи, в которых используется этот метод: - ЗППП и инфекции мочевыделительной системы (хламидиоз, трихомониаз, микоплазмоз и др.); - Кишечные инфекции (дизентерия, брюшной тиф, сальмонеллёз); - Хронические поражения органов дыхательной системы (синуситы, тонзиллиты, бронхиты, пневмонии); - Гнойные процессы различной локализации, в том числе гнойничковые поражения кожи; - Дисбактериоз слизистых структур (кишечника, половых органов, ротовой полости); - Сепсис (общее заражение крови).