Контроль и надзор за финансовым рынком со стороны Агентства Республики Казахстан осуществляется следующим образом: Разработка и принятие нормативных правовых актов в пределах своей компетенции, которые обязательны для исполнения финансовыми организациями. Проведение проверок и иных форм контроля и надзора в пределах полномочий, установленных законодательством Республики Казахстан, в том числе с привлечением Национального Банка Республики Казахстан, аудиторских организаций, оценщиков и специалистов в области финансовых технологий. Направление своего представителя в банки, банковские холдинги, организации, осуществляющие деятельность по управлению инвестиционным портфелем, страховые (перестраховочные) организации, страховые холдинги. Выявление нарушений законодательства Республики Казахстан в финансовой сфере и деятельности, связанной с концентрацией финансовых ресурсов, и принятие мер в порядке, установленном законодательством Республики Казахстан. Использование мотивированного суждения в отношении банков, филиалов банков-нерезидентов Республики Казахстан, организаций, осуществляющих отдельные виды банковских операций, банковских холдингов, крупных участников банка и других субъектов финансового рынка. Также одной из функций Агентства является осуществление реализации программ рефинансирования ипотечных жилищных займов и ипотечных займов физических лиц, осуществляемых через дочерние организации Национального банка Республики Казахстан, и контроль за исполнением банками обязательств, принятых в рамках этих программ.