Лимонное дерево — небольшое вечнозелёное плодовое дерево высотой до 5–8 м, с раскидистой или пирамидальной кроной. Кора сероватая, слегка трещиноватая на многолетних ветвях и зелёная или красновато-фиолетовая, гладкая на однолетних побегах, обычно с колючками, реже без них. Листья с характерным запахом, кожистые, зелёные, длиной 10–15 см, шириной 5–8 см, глянцевые, лоснящиеся с верхней стороны и светло-зелёные и матовые с нижней. Цветки одиночные или парные, диаметром 2–3 см, чисто белые или кремово-белые, сильно отогнутые, с тонким ароматом. Плоды яйцевидной формы, жёлтые с сочной мякотью зеленовато-жёлтого цвета, кисло-терпкого вкуса.