Қорғалжын мемлекеттік табиғи қорығының флорасы мен фаунасы туралы ақпарат табылмады. Алайда, оның аймағында 357 құстардың түрі мекендейді. Қорғалжындағы көлдерде әртүрлі балық түрлері тіршілік етеді: алтын және күміс қарашық, язь, балық, окунь, линь, налим және плотва.