Помимо бизнеса, Андрей Мельниченко известен своей благотворительной деятельностью. В октябре 2016 года предприниматель создал свой собственный благотворительный фонд. По данным РИА «Новости», Андрей Мельниченко входит в число основных социальных инвесторов и благотворителей России. В 2016 году Мельниченко за свою благотворительную и социальную деятельность получил российскую государственную награду — знак отличия «За благодеяние». Кроме того, Андрей Мельниченко входит в Совет благотворительной организации «Фонд поддержки олимпийцев России», целью которой является развитие и укрепление российского олимпийского движения.