Ғылыми-зерттеу бөлімшелері ЕНУ-да келесі қызметтерді ұсынады: жоспары бойынша өткізілетін ғылыми-зерттеу және тәжірибелі-құрылымдық жұмыстарды ұйымдастыру және үйлестіру; оқытушылардың, студенттердің, магистранттарының және докторанттарының инновациялық жобаларын іске асыруға көмектесу; жаңа техника мен технологияны, жаңа ғылым және оқу әдістемелері мен әдіснамасын әзірлеуге көмектесу, кеңес беру; ғылыми зерттеулер мен әзірлемелерге университеттің және басқа да ЖОО-лардың (шетелдік ЖОО қоса) оқытушыларының, студенттерінің, магистрлерінің және докторанткарының әртүрлі формада қатысуының негізінде ғылыми, ғылыми техникалық және білім беру қызметін біріктіру; өткізетін ғылыми жұмыс нәтижелерін өндіріске және оқу үрдісіне енгізу; гранттарды, ғылыми стипендияларды және сыйақыларды алу мақсатында ғылыми конкурстарға ұсынылатын құжаттарды дайындауға жәрдемдесу; зияткерлік меншік нысандарын құқықтық қорғауды қамтамасыз етуге көмек көрсету.