Жалпы ғылыми әдістердің кейбірі эмпириялық деңгейде (бақылау, эксперимент, өлшеу) қолданылады, басқалары тек теориялық деңгейде қолданылатын (идеалдау, формалау), ал модельдеу эмпириялық және теориялық деңгелерде де қолданылуда. Жалпы ғылым әдістеріне мыналар жатады: бақылау; тәжірибе; анализ және синтез; жорамал және гипотеза; индукция және дедукция; аналогия; классификация және систематизация; генетикалық әдіс; модельдеу.