Жаксыбек Кулекеев специализируется в областях экономики, статистики, образования, государственного управления и государственной службы. Некоторые научные достижения: Автор и соавтор книг: «Основы линейного программирования» (1991), «Практические занятия по микроэкономике» (1994), «Инвестиционные институты и процессы приватизации» (1995), «Государственные ценные бумаги в экономике Казахстана» (1996), «Введение в проектный анализ» (1996), «Микроэкономика» (1997), «Макроэкономика» (1997, 2003), «Земельные отношения в условиях перехода к рынку» (1999), «Экономическая панорама Казахстана за годы независимости» (2003), «Проблемы эффективности использования средств государственного бюджета Республики Казахстан в условиях развития рыночных отношений» (2003), «Экономический рост и расходы государства» (2004), «Системы менеджмента качества организаций высшего профессионального образования» (2005). Также Кулекеев — кандидат экономических наук, тема диссертации: «Совершенствование двухсекторной модели воспроизводства и её использование в прогнозировании макроэкономической динамики (на примере КазССР)» (1986).
