Съёмки фильма «Сёстры» проходили в Санкт-Петербурге . Среди использованных локаций — СИЗО №5, дом «Ленсовета», набережная Мартынова .
Также съёмки проходили в городах Ленинградской области — Кировске, Шлиссельбурге и посёлке городского типа Мга, где снимали сцены около железнодорожной станции .