Бауыржан Момышұлы келесі марапаттармен марапатталды:
Ленин ордені (1990, қайтыс болғанда) ;
Қызыл Ту ордені (2 рет) ;
Ұлы Отан соғысының ордені бірінші дәрежелі (1945) ;
Еңбек Қызыл туы ордені (1971) ;
Халықтар достығы ордені (1980) ;
Қызыл Жұлдыз ордені (1953) .
Сонымен қатар, «Әскери еңбегі үшін», «Мәскеуді қорғаны үшін» және «Германияны жеңгені үшін медальдарымен марапатталады .