Капибары считаются социальными животными, потому что они живут в группах по 10–20 особей . Группы состоят из доминирующего самца, нескольких взрослых самок (у них собственная внутренняя иерархия), детёнышей и подчинённых самцов, находящихся на периферии группы .
Члены группы общаются свистом, лающими и щёлкающими звуками . Также капибары умеют обмениваться запахами: на носу и около анального отверстия у них есть специальные пахучие железы, выделяющие сильные запахи, которыми животные обмениваются друг с другом .
Изредка капибары живут в одиночку, преимущественно самцы . Чем засушливее местность, тем крупнее группы; в засуху вокруг водоёмов иногда скапливается до нескольких сотен особей .