Қырғыз Алатауында өсімдіктердің тізілімі бар, олардың кейбіреулері:
- Дәрілік өсімдіктер . Мысалы, роза, арменіақа, қара сексеуіл, Potentilla anserina, Potentila asiatica, Rosa acicularis, Rosa beggeriana, Rubus caesius, Sorbus tianschanica .
- «Розарий» жиі . Қырғız Алатауының 1500–1700 м және 2000–2100 с биіктіктерінің аралығындағы алқапта өседі .
Қырғыз жотасының әрбір бөлігінің өзіндік сипаты бар . Ортаңғы бөлігінде жартылай шөлейттен нивальді қоса алғанға дейінгі барлық белдеулер ұсынылған .