Японский краб-паук обитает в Тихом океане у побережья Японии на широте от 30 до 40 градусов северной широты, между островами Хонсю и Кюсю . Чаще всего он встречается в бухтах Тоса, Сагами, Суруга, у берегов полуострова Кии . Изредка встречается на востоке Тайваня .
Крабы предпочитают песчаное, каменистое дно материковой отмели, её склоны с глубинами от 150 до 300 метров, изредка встречаются на глубинах до 600 м . Взрослые особи предпочитают температуру воды 9–10 °С, молодняк обитает на мелководье 150–200 м, с более высокой температурой .