Сырдария өзенінің бастауы Қырғызстан мен шығыс Өзбекстандағы Тянь-Шань тауларындағы екі өзеннің: Нарын және Қарадария өзендерінің қосылуы .
Нарын және Қарадарья Қырғыз Республикасы аумағында басталған . Қосылған жерде Сырдария Қырғyzстан, Тәжікстан, Өзбекистан және Қазақстан аумақтарында ағып өтеді . Содан кейін өзен Арал теңізіне құяды .