Шағын жинақталған мектептің оқу үрдісін ұйымдастырудың ерекшеліктері:
- мұғалім бір мезгілде екі сыныппен қатар жұмыс істейді ;
- екі сыныптың оқу бағдарламаларын сәйкестендіру ;
- оқу сағаттары, жүктемелерін сәйкестендіруді ұйымdaстыру .
Шағын жинақты мектепті оқу-тәрбие жұмысын жетілдіруде тірек мектептерді қолдану тиімді . Жақын орналасқан шағын жинағы мектептелерді біріктіретін, білім беру ұйымы болып табылатын тірек мектепке (ресурстық орталыққа) оқушылардың сапалы білімге қол жеткізуіне жағдай туғызады .