Шағатай ұлысының құрылу тарихы туралы ақпарат табылмады. Алайда, Шағатай хан 1224–1346 жылдары билік құрған . Ол Жетісу, Мәуереннахр сияқты өңірлерді иеленген .
Шағатай өлгеннен кейін Шағатай әулетіне Есу-Мөңке хан келіп, оның билігі XIV ғасырдың басына қарай шыңғыс хан империясының қолына тиді . Шағатайдың ұлыстарындағы бұл таластар, өзара қырқысулар XIV ғасырда ұлыстың ыдырауына себеп болды .