Нәруыз молекулалары өте күрделі болатын, пептидтік байланыспен байланысқан аминқышқылдардан тұрады .
Нәруыздардың құрылымына қарай төрт түрге бөлінеді:
Бірінші реттік құрылым . Полипептидтік тізбектегі әртүрлі аминқышқылдарының қалдықтары кезектесіп байланысып жатыр . Мысалы: ала-ли-вал-вал-иле-…
Екінші реттік . Нәруыздардың молекулалары полипептидтер тізбегінің кеңістіктегі оралма тәрізді болып келген пішініне сәйкес келеді . Мұнда оралманың көрші оралмадағы —NH— және —CO— топтарының арасында түзілген сутектік байланыстар түзіледі .
Үшінші ретті . Пептидті байланысты оралымға айналғанда ондағы радикалдар сырттап қалады . Сол радикалдардан нәруыздың үшінші құрылысы түзіледі, мысалы, фосфоглицераткиназа ферментінің үшінші реткі құрылысын қамтитын .
Төртінші реттіс . Бірнеше шумақталған оралымнан тұратын, яғни бірнеше нәруиз молекулаларының қосындысы .