Нәруыз құрылымының төрт деңгейлі болып жіктеледі:
Бастапқы құрылым . Полипептидтік тізбектегі әр тұрғын аминқышқылдың қалдықтары кезектесіп байланысты .
Екінші ретті құрылым (вторичная структура) . Нәруыздардың молекулаларының кеңістіктегі оралма тәрізді болуы . Оралманың көрші оралмадағы –NH- және –CO- топтарының арасында түзілген сутектік байланыстар түзіледі .
Үшінші ретті (третичная) құрылым . Полипептидтік байланыс оралымға айналғанда ондағы радикалдар сырттап қалады . Бұл радикалдардан нәруыз молекуласының үшінші құрылысы түзіледі, ол полипептид араласқан радикалдардың қосындысы ретінде қарастырылады .
Төртінші рет (четвертичная) . Бірнеше шумақталған оралымнан тұрады, яғни бірнеше нәруиз молекулалары қосылған .