Микроорганизмдердің құрылысы мен қызметі туралы ақпарат табылмады. Алайда, микроорганизмдер — бұл бұршақтар, шашықтар немесе серпілмелі формадағы жасушалар . Олардың құрамына қабырға, цитоплазматикалық мембрана, цитоплазма, капсула, микрокапсула, қосымша құрылымдар кіреді .
Микроорганизмдер әртүрлі түрлердегі жағдайларға қатысты әртүрлі қажеттіліктерге ие болады . Кейбір микроорганизмтер паразиттік, симбионттық немесе еркін тұратын организмдер болып табылады . Микроорганизмнің барлығының ішінде паразиттер, симбиоттар және патогендер болуы мүмкін .