Лизосомалар құрылымды, молекулаларды және заттарды гидролиздеуге жарамды ферменттерді (кислых гидролаз) қамтиды . Олар ақуыздардың, көмірсулардың және нуклеиндік қышқылдардың байланыстарын бұзады .
Лизосомалар клетканың ішкі макромолекуласын сүзуге міндетті . Бұл процестің мақсаты — молекулаларға қарағанда қарапайым молекулалар жасау, оларды қайталандыру үшін . Мысалы, ақуызлар аминокислотына, көп молекулалық көмір сусырықтарға, липидтер — қарағайлық қышқылдарына айналады .