Хемосинтез және фотосинтез — ағарту процесілері, автотрофтық ағзалар үшін өмірлік көздерді құруға мүмкіндік береді . Бұл процестердің айырмашылықтары:
Энергияның көзін қамтамасыз ету . Фотосинтез кезінде энергия — күн сәулесінің энергиясы, ал хемосинтез кезінде — неорганикалық қосылыстардың энергиясы .
Хемосинтездің первичтік энергия көзі . Фотосинтездің — АТФ энергиясы
Фотосинтезте хлорофилл бар, ал хемосинтезда — емес
Хемосинтез тек бактериялар мен археяларда жүзеге асады .