Пифагор родился на острове Самос (современная Греция) в семье богатого торговца Мнесарха .
Образование Пифагор получил следующим образом: в юности он учился в Милете, где слушал Анаксимандра и Ферекида . Затем совершил путешествие на Восток, в том числе в Египет и Вавилон, где познакомился с древневосточной математикой и астрономией и изучал негреческие религиозно-культовые традиции .
Первый учитель Пифагора, Гермодамант, учил его музыке, живописи, технике чтения, грамматическим основам и риторике . Развивая память своего ученика, Гермодамант просил его заучивать наизусть отрывки из «Илиады» и «Одиссеи» Гомера .