Экологический мониторинг бывает трёх видов:
Биоэкологический . Первоначальная ступень, на которой проводят отслеживание и контроль качества окружающей среды, а также степень её воздействия на состояние людей и уровень их здоровья .
Геосистемный . Отслеживание изменений в естественных экосистемах и формирование антропогенно-природной геосистемы .
Биосферный . Контроль и мониторинг природной среды, а так же прогнозирование глобальных изменений в экологической системе планеты, включая био-, гидро-, лито- и атмосферу .