Комплементарность в контексте строения ДНК — это пространственная взаимодополняемость мономеров ДНК нуклеотидов (цитозин, гуанин, тимин и аденин), приводящая к образованию связей между ними .
Напротив аденина одной цепи всегда располагается тимин другой цепи, напротив гуанина — цитозин . Между аденином и тимином всегда возникают две, а гуанином и цитозином — три водородные связи .
Таким образом, пары нуклеотидов аденин и тимин, а также гуанин и цитозин строго соответствуют друг другу и являются комплементарными друг другу . Зная последовательность расположения нуклеотидов в одной цепи ДНК, по принципу комплементарности можно установить нуклеотиды другой (второй) цепи .