Атомдар мен молекулаларды ажыратуға болады, олардың атомдардың бір түрінен немесе әр түрлі элементтерден тұратын молекулаларының айырмашылығы .
Атомдардың бір-бірімен қосылатын кезде олар молекула түзеді . Мысалы, су молекуласы екі сутегі атомынан және H2O деп жазылған бір оттегі атомдарынан тұрады .