Мугоджары имеют значение для экономики Казахстана благодаря своим минеральным ресурсам . В горах разведаны месторождения меди, никеля, марганца, редких металлов, фосфоритов и угля .
Кроме того, на западном склоне Мугоджар берут начало реки Эмба и Орь (бассейн Каспийского моря), а на восточном — правые притоки реки Иргиз . Часть западного склона используется под сельское хозяйство, а восточная часть пригодна только для выпаса скота .
Также в Мугоджарах встречаются месторождения хрома, в частности Кемпирсайская и Донская группы месторождений, содержащих высококачественные руды . Эти руды являются обязательным компонентом при выплавке нержавеющей стали, а хром экспортируется в 40 стран мира .