Қазақстан Республикасы Денсаулық сақтау министрлігінің міндеттеріне мыналар жатады:
мемлекеттік саясатты қалыптастыру және жүзеге асыру ;
тұрғындардың денсаулығын сақтау ;
медициналық және фармацевтикалық ғылым, білім беру және өнеркәсіп салаларында басшылыққа шығару ;
дәрі-дәрмектерді, медициналық бұйымдарды және олардың қозғалысын бақылау ;
санитарлық-эпидемиологиялық жағдайды сақтау, техникалық регламенттер мен нормативтік құжаттармен белгіленген талаптарды сақтап қалуды бақылаудағы бақылау және бақыландыру ;
тағам өнімдерінің қауіпсіздігін қамтамасыз ету .