Қазақстандағы денсаулық сақтау жүйесінің мәселелері мыналарды қамтиды:
ауылда білікті мамандардың жетіспеуі ;
денсаулық саласындағы мамандарға дайындық деңгейінің төмендігі ;
медициналық қызметкерлердің төмен жалақысы, төмен әлеуметтік пакеті ;
аймақтық медициналық мекемелердегі аппаратурамен аз жабдықталуы ;
мемлекеттік басқару органдарындағы жемқорлық ;
дәрігерлердің жіберген дәрі-дәрмек қателігі үшін жауапкершілігінің төмендеуі және дәлелдеудің және жауаптылыққа тартудың қиындығы .