Гендік модификацияланған өнімдердің адам денсаулығына әсері толықтай зерттелмеген . Бірақ олардың пайдалануының кейбір зиянды әсерлері белгілі:
- Өте қауіпті аллергиялық реакциялар . Мысалы, АҚШ-та ГМО өнімдерін еркін қолданып жатқандардың 70% аллергиямен ауырады .
- Трансгенді өнімді пайдалану асқазанның сілемейлі қабатының құрылымын бұзады, зат алмасудың бұзылуына және иммунитеттің төмендеуіне әкеледі .
ГМО қолданған ағзаларда да өзгерістер болатыны анықталған . Тышқандарға жүргізілген эксперименттерде ГМ құрамы олардың ұрпақтарынан да табылған