Негізгі ұғымдар, органикалық химияның негізінде тұр:
Қабыну . Қабыну органикалық қосылыстардың құрамына қышқыл мен су атындағы көмірсулар кіреді .
Радикалдар . Радикал — реакция кезінде бастапқы молекуладан тұрақты түрде соңғы молекулаға өтуші атом топтары .
Типтер теориясы . Ш. Ф. Жерар 1851 жылы органикалық заттарды төрт тип неорганикалық заттардан (су, су, хлорсу, аммиак) құруға болатынын көрсетті . Мысалы, барлық спирттер суға, барлық аминдер — аммиакке ұқсайды, барлық хлорданғандар — хлорсуға .
Негізгі теорияны органикалық химияда Александр Бутлеров ұсынды . Ол заттардың қасиеттері молекуланың құрылымынан, сондай-ақ сапалы және саны бойынша да әсер етеді .