В сентябре климат в Полярном можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 10 градусов тепла. В среднем в сентябре в Полярном 14 дождливых, 12 пасмурных, 3 ясных и 1 день с переменной облачностью. Дожди преимущественно слабые. В сентябре, а также в апреле, мае, июне и июле Полярный cчитается местом, некомфортным для посещения.