В июне климат в Неготино можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 21 градус тепла. В среднем в июне в Неготино 11 ясных, 10 дождливых и 9 дней с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные.